Gimnasia y Esgrima de Jujuy comenzó a participar de forma regular en torneos de Asociación del Fútbol Argentino en 1986, como consecuencia de una gran reforma estructural de las categorías. Desde entonces han transcurrido 35 temporadas (32 con formato invierno-invierno, 1 de año calendario y 2 cortas de transición). Estos son los jugadores que anotaron más goles para el «Lobo» en cada una de ellas.
En la temporada 1986/7 Carlos Ramón Rosas se instaló en lo máximo con 13 tantos, en la 87/88 Oreste Quiroga alcanzó los 6 goles, después en la 88/89 fue Horacio Zingariello con tan solo 3 goles, demostrando la falta de goles de aquella época. Después en la temporada 89/90 volvió a aparecer el nombre de Carlos Ramón Rosas anotando 12 tantos, recién en la 91/92 surge el nombre de Mario Humberto Lobo que llega a convertir 8 goles.
En la temporada 1992/3 Manuel Guerrero emerge con 13 tantos y vuelve a repetir el liderazgo en la 93/94 pero esta vez se hace presente con 14 goles. En la temporada 1994/5 Mario Lobo vuelve con 8 goles, ya en la 95/96 sobresale Marcelo Trimarchi, en tanto que en la temporada 96/97 Carlos Morales Santos aparece con 9 goles, ya en la 97/98 en un gran torneo de Gimnasia, lo tienen a Carlos Casartelli como máximo artillero con 10 tantos.
En la 98/99 vuelve Mario Humberto Lobo con 19 tantos, siendo el que más anotó en un torneo y repite en la 99/2000 en la última temporada de Gimnasia en primera división, pero antes anotó 7 goles. Ya en el regreso a la segunda categoría, en el 00/01 Adrián Carlos Czornomaz anota 13 tantos, el “Pirata” estuvo en un gran equipo, pero lamentablemente no se logró regresa a primera.
En la temporada 2001/2 Daniel Juárez alcanzó los 12 goles, en la siguiente 02/03 vuelve Mario Humberto Lobo con 6 goles y 2003/3 surge el talentoso enganche Paolo Frangipane con 14 goles.
En la 2004/5 Gustavo Balvorín anotó 15 goles para que Gimnasia regresa a la máxima categoría, ya en primera, Héctor Silva alcanza 11 goles, en la 2006/7 Gustavo Balvorín regresa y esta vez convierte 7 goles, en la 2007/8 César Carranza trepa a la tabla de goleadores con 12 tantos, a la temporada siguiente 2008/9 Juan José Arraya convierte 5 tantos y el Lobo regresa nuevamente a la B Nacional.
En la segunda categoría 09/10 Juan Arraya llega a 10 goles, luego Darío Benedetto en la 10/11 anota 11 tantos, en la 11/12 Jorge Luna convierte 8 goles, en la 12/13 Fernández llega a 8 goles, en la 13/14 Matías Quiroga se instala como el goleador para lograr la permanencia con 11 goles, luego 2014 Federico Haberkorn tan solo llega a 3 goles, en la 2015 Milton Céliz anota 8 goles, en la 2016 Sufi convierte 6 tantos, en la 2017, Luis Vila anotó 11 goles, en la 2017/18 Blanco se hace presente con 6 goles, en la 2018/19 Nicolás Contín convierte 5 goles y 2019/20 Gonzalo Castillejos alcanza 7 tantos.
Los datos extras: marcan Mario Lobo es quien más veces fue goleador (5 veces). Le siguen Carlos Ramón Rosas (3), Manuel Guerrero, Gustavo Balvorín y Juan José Arraya (2). La mejor campaña sin duda es la de Mario Humberto Lobo en la 1998/99. Pico máximo de goles y se trató además de una temporada en Primera División. El mejor promedio de gol en una temporada lo tuvo Rosas en la 1989/90. Disputó 13 encuentros ese torneo y marcó 12 goles, casi un gol por partido (0,9). Los números también marcan que 5 jujeños en la lista: Mario Humberto Lobo, Manuel Guerrero, Daniel Juárez, Juan José Arraya y Agustín Sufi.
